Чи можна використовувати довідкову ціну для оцінки авто

Так, можна спиратися саме на лист від донора для визначення вартості.
Ви можете використати ціну, вказану в листі від донорів, але як документ, на підставі якого комісія складе внутрішній акт оцінки (визначення справедливої вартості) такого отриманого автомобіля.
Оскільки автомобіль отримано безоплатно як гуманітарна допомога, його первісна вартість для зарахування на баланс визначається за справедливою вартістю на дату отримання (п.10 П(С)БО 7 "Основні засоби"). https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/z0288-00#o52

Також при визначенні такої справедливої ціни комісія повинна проаналізувати ринкову ціну на схожі моделі, щоб така самостійно визначена вартість не була занадто занижена чи завищена.

На підставі акта оцінки та акта приймання-передачі ви робите наступні проводки в бухобліку
Дт 105 - Кт 483 (або 484)

Якщо таке авто буде використовуватися в діяльності, то при введенні в експлуатацію встановлюєте строк його корисного використання та нараховуєте амортизацію щомісяця.
Дт 92 (або 949) - КТ 131

Так як авто отримано безкоштовно і використовується в межах вашої статутної діяльності, то при нарахуванні амортизації ви відразу визнаєте доходи
Дт 483 (або 484) - Кт 745 "Дохід від безоплатно одержаних активів"

Раді допомогти, звертайтесь ще!