Якщо сума обідів працівника 1000грн оподатковується не як зарплата, а як додаткове благо, то визначаємо дохід для застосування ПСП з зарплати 13000грн.

Право на ПСП на 3-х дітей мають працівники, що написали заяву на її застосування та надали документи, що підтверджують надання їм пільг (п.169.2.2 ПКУ) й відповідають критеріям застосування ПСП.
Платник податку на доходи фізичних осіб має право на зменшення суми загального місячного оподатковуваного доходу, отримуваного від одного роботодавця у вигляді заробітної плати (інших прирівняних до неї відповідно до законодавства виплат, компенсацій та винагород), якщо його розмір не перевищує суми, що дорівнює розміру місячного прожиткового мінімуму, діючого для працездатної особи на 01 січня звітного податкового року, помноженого на 1,4 та округленого до найближчих 10 гривень (п. 169.1 ПКУ https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/2755-17?find=1&text=#n3914 ).
Для одного з батьків граничний розмір доходу визначається кратно кількості дітей. В вашому випадку граничний розмір 4660*3=13980грн., зарплата 13000грн, тому ПСП застосовуємо.

Раді допомогти, звертайтесь ще!