Коли є банківський екваринг через часовий розрив в обліку така операція відображається із застосуванням субрахунку 333 «Грошові кошти в дорозі в національній валюті» (https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/z0893-99#n355 ).

Відповідно будуть наступні проведення:

Дт 333 Кт 681 відображення оплати споживачем сайті на повну вартість;
Дт 311 Кт 333 зарахування коштів на поточний рахунок та одночасно Дт 93 Кт 333 на суму комісії, що утримана банком-еквайром.

Раді допомогти, звертайтесь ще!