Тільки якщо це передбачено положенням про відрядження.

У роз’ясненні ДПС ((https://zp.tax.gov.ua/media-ark/news-ark/705512.html)), окрім іншого, міститься ще і позиція податківців щодо відшкодування банківських витрат працівника:

"Працівнику відшкодовуються (за наявності документального підтвердження оплати) понесені у зв’язку зі службовим відрядженням комісійні витрати у разі обміну валюти, суми комісійної винагороди за надані банком послуги, пов’язані з використанням платіжних карток та готівки (з урахуванням особливостей системи фінансових розрахунків у державі відрядження), зокрема, відшкодовуються витрати, пов’язані з перерахуванням авансу на поточний рахунок працівника; поверненням коштів з рахунку працівника на відповідний рахунок підприємства; переказом грошових коштів електронними засобами – у безготівковій формі; проведенням безготівкових розрахунків у валюті, відмінній від валюти рахунку платіжної картки; отриманням готівки із застосуванням платіжної картки; конвертацією готівкової іноземної валюти у національну валюту держави відрядження; отриманням виписки банка-емітента платіжної картки."

Таким чином, у Вашому випадку комісії банку відшкодовуються як окремий елемент витрат у відрядженні, якщо це прямо передбачено положенням про відрядження.

Раді допомогти, звертайтесь ще!