Чи дозволено ТОВ на загальній системі користуватися linqpayment

Скоріше за все ні

Відповідно до вимог п.10.3 ст. 10 Закону Про платіжні системи та перекази коштів Учасниками платіжної системи в Україні мають право бути банк, що має банківську ліцензію Національного банку України, а також небанківська фінансова установа, яка має ліцензію Національного банку України на переказ коштів без відкриття рахунків, які уклали договори з платіжною організацією відповідної системи.
https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/2346-14#n208

Тому якщо провайдер такої платіжної системи не має ліцензії на здійснення переказів та зарахування вам на розрахунковий рахунок в національній валюті - гривні, то скоріше за все зареєструватися там та отримати оплати ви не зможете.
Адже якщо ви продаєте товар чи послуги на території України, то для вашого отримувача (покупця) повинні забезпечити розрахунки в гривні при сплаті карткою через посилання на сайті чи в особистому кабінеті.

Відповідно вам потрібно вивчити умови надання послуг такою платіжною системою, наявність в неї ліцензій на проведення платежів на території України та можливість вказання українського банківського рахунку для отримання туди відшкодувань (виплат) по прийнятих переказах.

Раді допомогти, звертайтесь ще!