Виписка компенсуючої податкової накладної за відшкодування комунальних послуг

Ні, не потрібно. Оскільки комунальні послуги оплачуються за рахунок загального фонду бюджету (фінансуються державою), ці суми не вважаються об'єктом оподаткування ПДВ. Відповідно, компенсуючу податкову накладну (ПН) за пунктом 198.5 ПКУ виписувати не потрібно. Сума відшкодування від орендаря просто обліковується як надходження до спеціального фонду установи.

Водночас варто перевірити, чи вся сума комунальних послуг компенсується орендарем, чи лише її частина. Якщо лише частина приміщення використовується в оподатковуваній діяльності, тоді може виникати питання пропорційного нарахування ПЗ за ст. 199 ПКУ або застосування п.198.5 щодо невідшкодованої частини. п. 198.5 - https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/2755-17#n4931 бюджетна установа — платник ПДВ, яка отримує кошти з держбюджету (загальний фонд) на оплату комунальних послуг, зобов'язана нарахувати компенсуючі податкові зобов'язання, якщо такі послуги використовуються для власної діяльності і оплата проводиться з бюджету.
Щодо заповнення компенсуючої ПН - відповідно до п. 16 Порядку заповнення податкової накладної, затвердженого наказом МФУ №1307 від 31.12.2015 (https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/z0137-16 - у номенклатурі слід зазначати конкретний вид послуги відповідно до первинних документів постачальника.
Щодо типу причини - відповідно до п. 8 Порядку №1307 - https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/z0137-16 слід зазначати тип причини «13», який застосовується саме для операцій, що не є господарською діяльністю - це ваш випадок, оскільки фінансування здійснюється з загального фонду бюджету.

Раді допомогти, звертайтесь ще!