Проблеми з реєстрацією РК та поверненням авансу постачальнику

Ні, постачальник таким чином ліміт не поверне

Дійсно, провести реєстрацію такого РК можна не пізніше 1095 днів з дати складання податкової накладної, до якої він складений. Це передбачено п.192.1 ПКУ.
https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/2755-17#n4621

А так як саме рестрація ПН та РК проводиться лише в робочі дні з 9 по 20 години, крім крайніх строків (5, 18 та 20 числа), коли реєстрація відбувається цілодобово, то такий РК технічно вже неможливо зареєструвати.

В цьому випадку податківці в ЗІР (категорія 101.15) рекомендують оформлювати так зване "зворотнє постачання", коли ви як покупець реєструєте не компенсуючу ПН, а звичайну податкову накладну на вашого постачальника на вказаний товар/послугу.
В такому випадку ви будете показувати збільшення свої зобов''язань, а ваш постачальник відповідно матиме податковий кредит.
https://zir.tax.gov.ua/main/bz/view/?src=ques&id=40043

Раді допомогти, звертайтесь ще!