На нашу думку, - ні, ця сума допомоги від Фонду енергоефективності не буде враховуатись в критерій 1 млн.грн. (ст. 181 ПКУ, https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/2755-17/ed20260101#n4401) для обов`язкової реєстрації платником ПДВ, адже це не є оплатою поставлених Вами товарів/послуг.

Це звичайна цільова благодійна допомога, яку Ви маєте використати на вказані цілі за програмою фінансування.

ЗІР (101.16, https://zir.tax.gov.ua/main/bz/view/?src=ques&id=36309):

"Чи повинен платник податку при отриманні коштів, які надійшли у вигляді гранту, в тому числі отримані у рамках проєкту міжнародної технічної допомоги, включати їх до бази оподаткування ПДВ та складати податкову накладну?
Відповідь:
Якщо кошти, які платник податку отримує у вигляді гранту, є оплатою вартості товарів/послуг які постачаються (у т.ч. третім особам), то платник податку повинен включити їх до бази оподаткування ПДВ, скласти і зареєструвати в Єдиному реєстрі податкових накладних (далі – ЄРПН) податкову накладну.
Водночас, платник податку не включає до бази оподаткування ПДВ і не складає податкову накладну, якщо отриманні у вигляді гранту кошти не є оплатою вартості товарів/послуг які постачаються (у т.ч. третім особам)..."

Раді допомогти, звертайтесь ще!