Для цілей бухобліку Ви звертаєте увагу тільки на дані про договірну вартість товару (гр. 22 та 42 в МД)

1. Як оприходувати ці партії товару (по інвойсній ціні?)

Так, оприбутковуєте даним інвойсу, звіряєтесь з гр. 22 та 42 МД

2. Оскільки цей товар звільнений від митних зборів та ПДВ, яку суми я повинна в декларації з ПДВ?

Оскільки товар звільнений від мита та ПДВ, то в декларацію з ПДВ ставите в ряд. 11.4 (обсяг без ПДВ з гр. 47 по базі для ПДВ)

3. Як це вплине на заповнення річної декларації з податку на прибуток?

Ніяк. В буобліку - "живі" цифри провдяться в Дт/Кт, ане митна вартість, що розрахована "від стелі"

4. як провести транс.витрати?

Витрати на транспортування товару, що їде до Вас - це Дт 28 Кт 63 (на збільшення вартості товару), так визначає НПСБО 9 (https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/z0751-99#o108):

"9. Первісною вартістю запасів, що придбані за плату, є
собівартість запасів, яка складається з таких фактичних витрат:
суми, що сплачуються згідно з договором постачальнику
(продавцю) за вирахуванням непрямих податків та знижок, наданих
постачальником (продавцем);

суми ввізного мита;
суми непрямих податків у зв'язку з придбанням запасів, які не
відшкодовуються підприємству; {
транспортно-заготівельні витрати (затрати на заготівлю
запасів, оплата тарифів (фрахту) за вантажно-розвантажувальні
роботи і транспортування запасів усіма видами транспорту до місця
їх використання, включаючи витрати зі страхування ризиків
транспортування запасів). "

Раді допомогти, звертайтесь ще!