Чи потрібно виписувати податкову накладну при умовному продажу

Ні, виписувати другу податкову накладну на різницю між собівартістю та ціною продажу не потрібно.

Чому собівартість тут не є орієнтиром?
Порядок визначення бази оподаткування ПДВ чітко регулюється абзацом другим пункту 188.1 Податкового кодексу України https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/2755-17#n4551 (ПКУ):

Для придбаних товарів мінімальна база оподаткування — це ціна їх придбання.
Для власновиготовленої (самостійно виготовленої) продукції (зокрема рослинної сировини власного врожаю) мінімальна база — це звичайна (ринкова) ціна, а не виробнича собівартість.

Поняття «собівартість» у нормі п. 188.1 ПКУ взагалі не згадується для власної продукції. Навіть якщо продукція продається збитково (значно дешевше витрат на її вирощування), донараховувати ПДВ до рівня собівартості закон не вимагає.

Що є «звичайною ціною» і як захистити ціну 27,60 грн?
Відповідно до пп. 14.1.71 https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/2755-17#n256 ПКУ, звичайною ціною вважається ціна, визначена сторонами договору. Якщо не доведено зворотне, вважається, що така договірна ціна відповідає рівню ринкових цін.

У разі перевірки обов'язок довести, що ціна не відповідає ринковій, покладається на контролюючий орган. Водночас ринкова ціна (згідно з пп. 14.1.219 https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/2755-17#n256 ПКУ) формується з урахуванням:

обсягу партії (мала кількість — 960 кг);
тривалості зберігання та втрати споживчих якостей (залишки 2024–2025 років);
логістичних витрат та фактичного попиту на ринку на таку партію.

Як правильно оформити документи, щоб не було претензій ДПС:

Скласти наказ/розпорядження керівника або службову записку:

Зафіксувати причини реалізації за такою ціною: тривале зберігання сировини (2024–2025 рр.), зниження схожості/товарного вигляду чи споживчих властивостей, обмежений попит, економічна недоцільність подальшого зберігання та висока питома вартість логістики для невеликої партії (960 кг).

Акт оцінки / комісійний висновок (за бажанням або уцінка):

За правилами НП(С)БО 9 «Запаси» п. 24 п. 25 https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/z0751-99#o88 , якщо чиста вартість реалізації запасів стає меншою за їх собівартість, такі запаси можуть бути попередньо уцінені до чистої вартості реалізації (Дт 946 — Кт 26/27). Проте навіть без проведення попередньої бухоблікової уцінки сам факт продажу за узгодженою ринковою ціною не створює об'єкта для «мінбазного» ПДВ.

Ви правильно зробили, склавши та зареєструвавши одну податкову накладну на покупця (тип причини 02 — неплатник) виходячи з фактичної договірної вартості 27,60 грн за 1 кг з ПДВ. Додаткову зведену ПН на себе з типом причини «15» складати не потрібно.

Раді допомогти, звертайтесь ще!