Податкові зобов'язання юрособи при купівлі автомобіля у фізособи

Ні, не потрібно.
За загальним правилом, коли однією стороною договору придбання рухомого майна виступає суб'єкт господарювання (юридична особа чи ФОП), а іншою - фізична особа, то саме така юридична особа чи ФОП є податковим агентом. Це передбачено в ст.173.3 ПКУ https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/2755-17#n4182

При цьому ставки податків встановлені в такому розмірі:

ПДФО: 0% – якщо це перший продаж авто протягом календарного року; військовий збір в такому випадку теж 0%
5% – якщо це другий продаж протягом року, військовий збір - 5%
18% – якщо це третій або наступні продажі в поточному році, військовий збір теж 5%

Про факт, чи є такий продаж першим чи іншим по черговості, фізична особа повинна зазначити в договорі або окремою заявою, про що теж вказано в п.173.3 ПКУ. До речі, такий договір обов'язково повинен бути укладений в письмовій формі, але нотаріального засвідчення в обов'язковому порядку не потребує.

Тому в вашому випадку ставка податків буде 0%. АЛЕ! при заповненні додатку 4-ДФ ви відображаєте такі виплати з кодом 105, при цьому графи 4, 4а, 5 та 5а залишаєте не заповненими.

Так як це не перша реєстрація транспортного засобу в Україні, то пенсійний збір при перереєстрації на нового власника теж не сплачується.
З переліком документів, які потрібні для оформлення права власності в органах МВС ви можете ознайомитися на офіційному сайті https://hsc.gov.ua/index/poslugi/informatsiya-dlya-yuridichnih-osib-torgovelnim-organizatsiyam-avtoshkalam/perelik-dokumentiv-shho-nadayetsya-yuridichnoyu-osoboyu-dlya-reyestratsiyi-perereyestratsiyi-tz/

Щодо транспортного податку.

Згідно з п.п. 267.2.1 п. 267.2 ст. 267 розд. ХІІ ПКУ, об’єктом оподаткування транспортним податком є легкові автомобілі, якщо одночасно виконуються такі умови:

- з року випуску минуло не більше 5 років (включно);
- середньоринкова вартість авто перевищує 375 мінімальних заробітних плат, установлених на 1 січня податкового (звітного) року. Станом на 01.01.2025 року - 3 млн. грн. Це не вартість по договору, а саме встановлений критерій Мінекономіки.

Тому якщо ваше авто попадає під цю категорію, то ви будете платником такого податку.
Переглянути ці показники ви можете за посиланням.
https://me.gov.ua/vehicles/CalculatePrice?lang=uk-UA

Раді допомогти, звертайтесь ще!