Коли правильно включити мінусовий РК у податкову декларацію

Якщо такий РК направлений на реєстрацію своєчасно, то краще подати уточнюючу декларацію за вересень.
Відповідно до п.192.1 ПКУ ви як постачальник маєте право зменшити свої податкові зобов'язання на підставі РК, який зареєстрований в ЄРПН, навіть якщо в описаній ситуації ви самі відправляли його на реєстрацію.

Якщо такий РК відправлений своєчасно, то після розблокування він зареєструється саме датою подання на реєстрацію. Тобто, вереснем, не листопадом. Хоча в реєстрі операцій в СЕА ПДВ ви і побачите його поточною датою листопада і реєстраційний ліміт теж зміниться в листопаді.
Але в самій квитанції про реєстрацію буде вказана дата подачі.

Тому в такій ситуації він підтягнеться в той місяць, коли фактично у вас виникало право на зменшення ПЗ (у вересень), Це ви зможете побачити на вкладці Інформація про суму перевищення, обравши період вересень 2025 р.

Саме тому, щоб "зрівняти" таке перевищення вам слід подати уточнюючий розрахунок саме до декларації з ПДВ за вересень.
При цьому ви маєте повне право включити його і в листопад, коли отримали рішення про розблокування. І навіть у жовтень, адже строки подачі звітності за жовтень ще не минули.
Але при цьому такий показник перевищення буде у вас відображатися і в вересні, і в листопаді (жовтні). Це не є помилкою, це технічні особливості системи СЕА ПДВ. Тому жодних штрафних санкцій за пізніше включення не передбачено.