Тут потрібно зясувати це уповноважений відокремлений підрозмід чи неуповноважений.
Головне підприємство може уповноважити відокремлений підрозділ нараховувати, утримувати і сплачувати (перераховувати) ПДФО до бюджету. Такий підрозділ має окремий баланс і власноруч веде розрахунки із застрахованими особами. Він є самостійним податковим агентом і платником ЄСВ. Тому і розрахунок він пподає за себе окремо (податковий розрахунок + додаток 1+додаток 4ДФ + додаток 5). Відповідно і середню зарплату будуть розраховувати за таким податковим розрахунком. Головне підприємсвто за такий підрозділ розрахунок взагалі не подає.

У разі, якщо відокремлений підрозділ юридичної особи не уповноважений нараховувати, утримувати і сплачувати (перераховувати) податок до бюджету, Розрахунок за такий підрозділ подає юридична особа до контролюючого органу за основним місцем обліку (підпункт "б" пункту 176.2. статті 176 ПКУ). юридична особа подає окремий Розрахунок з додатком 4ДФ по кожному з відокремлених підрозділів юридичної особи, не уповноважених нараховувати, утримувати і сплачувати (перераховувати) податок на доходи фізичних осіб до бюджету. ЗІР https://zir.tax.gov.ua/main/bz/view/?src=ques&id=42670 Тобто за такий неуповноважений підрозділ головне підприємство подає розрахунок + додаток 4ДФ. При чому в розрахунку не запонюють рядки щодо кількості працівників. Додатків Д1, Д5, Д6 за неуповноважений відокремлений підрозділ головне підприємство окремо не подає. Відповідно відомости про нарахований дохід та ЄСВ працівників філії буде відображений в додатку 1 головного підприємства. Відповідно дані із додатку 1, в тому числі за працівників філії будуть перенесені в розд 1 податкового розрахунку. А отже середня зарпалта для критичності в цьому випдаку буде визначатись в цілому по підприємству.

Раді допомогти, звертайтесь ще!