Відповідь на запитання: на нашу думку, коли друга частина оплати буде надходити вже без ПДВ, то Ви маєте узгодити з покупцем - чи не зміниться ціна товару (можен на вона впаде нн 20% від непаченої частини, а може без ПДВ залишиться на рівні, який був визначений з ПДВ). І тільки після цього покупець має доплатити Вам залишок за вартітсь товару, а Ви скласти на нього ПН без ПДВ. У Видатковій накладній також має бути вказана ціна без ПДВ (якщо вона буде єдина, то одним рядком), та сума ПДВ, що відповідає сумі першого авансу.

ДПСУ надавала зокрема, наступну відповідь по застосуванню "генераторно" пільги (tax.gov.ua/media-tsentr/novini/639759.html):

"Питання 7. Чи нараховуються податкові зобов’язання з ПДВ, якщо частина вартості обладнання оплачена до 11 листопада 2022 року, а фактичне його постачання та оплата залишку його вартості здійснюється в період дії податкової пільги?

На дату отримання від Покупця часткової попередньої оплати за товари («перша подія») Постачальник повинен був нарахувати податкові зобов’язання з ПДВ та скласти податкову накладну на Покупця з ПДВ і зареєструвати її в ЄРПН у встановлені Кодексом строки.

На дату фактичного відвантаження товару понад обсяг отриманої часткової попередньої оплати на неоплачену частину відвантажених товарів податкові зобов’язання з ПДВ не визначаються та податкова накладна складається без ПДВ." Раді допомогти, звертайтесь ще!