Амортизація автомобіля та ПДВ при передачі ЗСУ за договором

Така операція не є об'єктом оподаткування ПДВ

За договором позички право власності не передається, а залишається у вас як власника майна. Тому не відбувається операції з постачання. Відповідно і не буде об'єкту оподаткування ПДВ.
З цим погоджуються і податківці в своїх роз'ясненнях.
https://zp.tax.gov.ua/media-ark/news-ark/505671.html

Також про відсутність у вказаній операції ознак постачання, коли майно передається на користь ЗСУ чи інших військових формувань в період воєнного стану пишуть податківці в ІПК від 21.12.2022 №2302/ІПК/99-00-21-03-02-06.

Щодо амортизації, то виходячи з наведеного вище, таке авто формально продовжує залишатися у вас на балансі. Тому ви маєте право на амортизацію в бух.обліку. Адже в п.23 ПСБО 7 "Основні засоби" чітко вказано, що амортизація призупиняється на період його реконструкції, модернізації, добудови, дообладнання та консервації.
https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/z0288-00#o116

Саму ж амортизацію доцільно в цей період відносити на рах. 949 як інші витрати.

А от щодо податкової амортизації, то тут можуть виникнути податкові різниці в сумах бухгалтерської та податкової амортизації, якщо ви є платником з різницями.
Адже по суті така діяльність може бути визнана негосподарською саме для нарахування амортизації. Відповідно може виникнути необхідність припинення амортизації саме в податковому обліку на підставі пп.138.3.2 ПКУ,
https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/2755-17#n10662

Раді допомогти, звертайтесь ще!