Чи враховується компенсація комунальних послуг для реєстрації ПДВ

Так, включається

Таке постачання послуг вважається оподатковуваною операцією в розумінні п.181.1 ПКУ і є базою оподаткування ПДВ за загальною ставкою 20%. Тому такі отримані суми будуть враховуватися в розрахунок ліміту для реєстрації платником ПДВ на загальних підставах.

В п.188.1 ПКУ є визначення бази оподаткування:
https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/2755-17#n4551

База оподаткування операцій з постачання товарів/послуг визначається виходячи з їх договірної вартості з урахуванням загальнодержавних податків та зборів (крім акцизного податку).
Виняток становлять лише бюджетні організації. Для них в п.188.1 є окремий виняток.

До бази оподаткування включаються вартість товарів/послуг, які постачаються (за виключенням суми компенсації на покриття різниці між фактичними витратами та регульованими цінами (тарифами) у вигляді виробничої дотації з бюджету та/або суми відшкодування орендодавцю - бюджетній установі витрат на утримання наданого в оренду нерухомого майна, на комунальні послуги та на енергоносії), та вартість матеріальних і нематеріальних активів, що передаються платнику податків безпосередньо отримувачем товарів/послуг, поставлених таким платником податку.

Тому при визначенні обсягів постачання для обов'язкової реєстрації платником ПДВ ви враховуєте і безпосередньо вартість оренди, і вартість комунальних послуг. Незалежно від того, чи включені вони в один рахунок, чи виставляються окремими рахунками.
Роз'яснення щодо бази оподаткування є також в ЗІР (категорія 101.04)
https://zir.tax.gov.ua/main/bz/view/?src=ques&id=43905

Раді допомогти, звертайтесь ще!