Чи потрібно відновити відмітку про незастосування різниць у декларації

Ні, не правильно.

Адже на думку податкової таку відмітку треба було дуублювати у кожній декларації з прибутку допоки Вами не буде перевищено 40 млн грн. Так, в категорії у категорії 102.20.02 ЗІР - https://zir.tax.gov.ua/main/bz/view/?src=ques&id=42930 вказано: "Якщо у наступних звітних періодах такий платник використовує право на незастосування коригувань фінансового результату до оподаткування, то у Деклараціях також проставляється відповідна позначка із зазначенням інформації щодо номеру та дати розпорядчого документа підприємства, на підставі якого прийнято таке рішення в Декларації за перший рік в такій безперервній сукупності років".
Тобто, судячи з цього, податкова хоче, щоб "безкоригувальна" відмітка дублювалася у всіх деклараціях, в яких не досягнуто 40-мільйонного критерію.

Зараз, якщо у Вас доход до 40 млн грн, то ставити таку відмітку обов'язково.

Раді допомогти, звертайтесь ще!