Згідно з п.п.14.1.266 ПКУ (https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/2755-17/conv#n256 ) касовий метод ПДВ – обліку – це «метод податкового обліку, за яким дата виникнення податкових зобов'язань визначається як дата зарахування (отримання) коштів на рахунки платника податку в банку/небанківському надавачу платіжних послуг, на електронний гаманець у емітента електронних грошей та/або на рахунки в органах, що здійснюють казначейське обслуговування бюджетних коштів, у касу платника податків або дата отримання інших видів компенсацій вартості поставлених (або тих, що підлягають поставці) ним товарів (послуг), а дата віднесення сум податку до податкового кредиту визначається як дата списання коштів з рахунків платника податку в банку/небанківському надавачу платіжних послуг, з електронних гаманців у емітента електронних грошей та/або з рахунків в органах, що здійснюють казначейське обслуговування бюджетних коштів, дата видачі з каси платника податків або дата надання інших видів компенсацій вартості поставлених (або тих, що підлягають поставці) йому товарів (послуг)».

У Вашому випадку при здійснені постачання товарів/надання з боку ТОВ 1 на адресу ТОВ2 повинні були нараховані зобов’язання з ПДВ (п.п.187.1 «а» ПКУ, https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/2755-17/conv#n4528 ).

Але ТОВ2 не мало право на включення такої ПН до складу податкового кредиту – тому що з його боку (з боку ТОВ2) не відбувається ні оплата, ні «надання інших видів компенсацій».

Тому у разі здійснення взаємозаліку та реєстрації змін до статутного капіталу для ТОВ2 і відбувається компенсація з його боку («інша», тобто не грошова ) на адресу ТОВ1.

Відповідно – і виникає право на податковий кредит. Інших наслідків з ПДВ для ТОВ2 та ТОВ1 не повинно бути.

При цьому вважаємо, що немає значення те, що ТОВ 1 та ТОВ 2 є пов'язаними особами

Раді допомогти, звертайтесь ще!