Згідно з пп. "г" п. 141.4.1 ПКУ, доходами з джерелом походження з України визнаються, зокрема, доходи від фрахту

Це залежить від суті послуг, які надає нерезидент. Дис. також роз'яснення ДПС https://if.tax.gov.ua/media-ark/news-ark/626479.html

Якщо нерезидент є безпосереднім перевізником (використовує власний або орендований транспорт), то виплата йому вважається фрахтом і оподатковується за ставкою 6% у джерела виплати.
Якщо нерезидент виступає як експедитор (організовує перевезення, залучаючи третіх осіб-перевізників), то компенсація вартості таких послуг не є об'єктом оподаткування в Україні.

Оподаткування доходів нерезидентів із джерелом походження з України регулюється статтею 141 Податкового кодексу України (ПКУ). Ключовим для вашої ситуації є розмежування понять «фрахт» та «транспортно-експедиторські послуги».

1. Якщо нерезидент є безпосереднім перевізником (оподаткування фрахту)
Якщо ваш контрагент-нерезидент самостійно здійснює перевезення вантажу, використовуючи власний або зафрахтований (орендований) транспорт, то винагорода, яку ви йому сплачуєте, вважається фрахтом.

Визначення фрахту: Це винагорода (компенсація), що сплачується за договорами перевезення, найму або піднайму транспортного засобу для перевезення вантажів (Податковий кодекс України, п.п. 14.1.260).
Ставка податку: Сума фрахту, що сплачується резидентом на користь нерезидента, оподатковується за ставкою 6% у джерела виплати за рахунок таких доходів (Податковий кодекс України, п.п. 141.4.4).
База оподаткування: Базою є базова ставка фрахту, що включає не лише вартість перевезення, а й витрати на навантаження, розвантаження, перевантаження та складування товарів, а також інші витрати за рейс, що відшкодовуються фрахтувальником (Податковий кодекс України, п.п. 14.1.12).
Місце надання послуг: Для оподаткування фрахту не має значення, що перевезення здійснюється за межами митної території України. Оподаткуванню підлягають доходи нерезидента із джерелом їх походження з України, яким є виплата від українського резидента.
2. Якщо нерезидент є експедитором (організатором перевезення)
Якщо за договором нерезидент зобов'язується лише організувати перевезення, залучаючи для цього інших осіб (фактичних перевізників), а ви компенсуєте йому вартість цих послуг та сплачуєте винагороду за організацію, то така операція не вважається фрахтом.

У цьому випадку дохід нерезидента розглядається як виручка або інший вид компенсації вартості наданих послуг. Такі доходи не підлягають оподаткуванню в Україні на підставі винятку, передбаченого Податковим кодексом України, п.п. «к» п.п. 141.4.1.

Важливе зауваження щодо міжнародних договорів
Якщо виплата нерезиденту кваліфікується як фрахт і підлягає оподаткуванню за ставкою 6%, ви можете застосувати положення міжнародного договору про уникнення подвійного оподаткування, укладеного між Україною та країною резиденції перевізника. Такий договір може передбачати нижчу ставку податку або повне звільнення від оподаткування. Для цього нерезидент повинен надати вам довідку, що підтверджує його резидентський статус у відповідній країні (Податковий кодекс України, п. 103.4).

Раді допомогти, звертайтесь ще!