Заборгованість перед постачальником (на рахунку 631 «Розрахунки з вітчизняними постачальниками») погашається в момент оплати. У вашому випадку оплата складалася з двох частин:

200 000 грн — сплачені підприємством.
1 000 000 грн — сплачені банком напряму постачальнику.
Платіж, здійснений банком, є виконанням вашого зобов'язання перед постачальником за рахунок кредитних коштів. Відповідно до Цивільного кодексу України, ст. 528, виконання обов'язку може бути покладено боржником на іншу особу.

Таким чином, заборгованість на рахунку 631 закривається двома операціями: вашою оплатою та оплатою банку. Одночасно з погашенням боргу перед постачальником у вас виникає борг перед банком за кредитним договором.

Облік операцій буде виглядати наступним чином (суми ПДВ умовні, виходячи з вартості 1 200 000 грн):

Отримання товару від постачальника:

Дт 281 «Товари на складі» — 1 000 000 грн
Дт 641/ПДВ «Розрахунки за податками» — 200 000 грн
Кт 631 «Розрахунки з вітчизняними постачальниками» — 1 200 000 грн
Часткова оплата постачальнику власними коштами:

Дт 631 Кт 311 «Поточні рахунки в національній валюті» — 200 000 грн
Отримання кредиту та оплата банком решти боргу постачальнику:

Дт 631 Кт 501 «Довгострокові кредити банків» — 1 000 000 грн (Цим проведенням закривається залишок заборгованості перед постачальником і одночасно відображається ваша заборгованість перед банком за кредитом).
Отримання компенсації від держави в рамках програми "5-7-9%": Компенсація частини основної суми кредиту є цільовим фінансуванням. Відповідно до НП(С)БО 15 «Дохід», таке фінансування визнається доходом протягом тих періодів, в яких були зазнані витрати, пов'язані з виконанням умов цільового фінансування.

Відображення погашення частини кредиту за рахунок компенсації: Дт 501 Кт 482 «Кошти з бюджету та державних цільових фондів» — 400 000 грн
Визнання доходу від цільового фінансування: Дт 482 Кт 718 «Дохід від безоплатно одержаних оборотних активів» — 400 000 грн
Після цих операцій залишок вашої заборгованості перед банком на рахунку 501 становитиме 600 000 грн (1 000 000 - 400 000).

Так, сума компенсації частини кредиту (400 000 грн) включається до складу інших операційних доходів підприємства в періоді її отримання (тобто в момент погашення частини боргу перед банком). Це підтверджується логікою обліку цільового фінансування. (там вище наведено проведення ДТ482Кт718 - оце і є воно)

Компенсуючу податкову налкадну за 198.5 ПКУ складати не потрібно:

товар повністю отримано та використано у звичайній господарській діяльності, отже підстав для нарахування компенсуючого ПЗ немає.

Оплата за рахунок банку або за рахунок державної компенсації не означає безоплатність постачання — у вас є повний контроль над товаром, ви його отримали, оприбуткували, відобразили в витратах.

Компенсаційна ПН згідно з п. 198.5 ПКУ потрібна лише, коли:

товар використовується у неоподатковуваній / пільговій діяльності;
товар було безоплатно отримано;
товар передається безоплатно третім особам;
ПДВ використовується не в госпдіяльності.

Отже, компенсуючу ПН згідно з п. 198.5 ПКУ у цій ситуації виписувати не потрібно. Компенсація державою банку не змінює статусу товару як отриманого за оплату.

Раді допомогти, звертайтесь ще!