Якщо кошти помилково перерахували на бюджетний рахунок, а не на електронний рахунок в СЕА ПДВ, ліміт реєстрації ПН не збільшиться і ПН не зареєструються.

Ліміт у СЕА ПДВ збільшується виключно при зарахуванні коштів на електронний рахунок платника ПДВ, відкритий в Казначействі (п. 200¹.3 Податкового кодексу України
https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/2755-17#n6002). Сплата ПДВ безпосередньо на бюджетний рахунок (як податкового зобов’язання) не впливає на формулу ліміту.

Якщо гроші пішли на бюджетний рахунок:
– ліміт не збільшиться;
– ПН не зареєструються;
– декларація з ПДВ за грудень буде з податковими зобов’язаннями, але ПН залишаться нереєстрованими, що тягне штрафи за ст. 120¹ ПКУ
https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/2755-17#n6237.

Практичний вихід:

- Перевірити рахунок — чи це саме електронний рахунок СЕА ПДВ (IBAN, який відображається в Е-кабінеті платника ПДВ у розділі "облікові дані").
- Якщо сплата була на бюджетний рахунок — подати заяву про повернення помилково сплачених коштів за ст. 43 ПКУ https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/2755-17#n4090 - але це пізніше вже зробите.
- Паралельно поповнити електронний рахунок ПДВ на суму, достатню для реєстрації ПН.
- Зареєструвати ПН та подати декларацію за грудень як останню відповідно до п. 184.6 ПКУ
https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/2755-17#n5054.

Якщо ПДВ-реєстрацію ще не анульовано, діяти потрібно терміново, інакше після анулювання зареєструвати ПН буде вже неможливо.

Раді допомогти, звертайтесь ще!