Може бути ризик визнання негрошової форми розрахунків
На скільки зрозуміли з вашого питання, то варто розділити окремо процес отримання коштів від покупця і процес оплати безпосередньо маркетплейсу.
Якщо розглядати операцію отримання коштів від покупця за проданий товар, то щоб не порушити умови перебування на єдиному податку, оплату за свої товари/послуги ви повинні отримувати грошовими коштами (в готівковій чи безготівковій формі). Це прямо передбачено п.291.6 ПКУ,
Платники єдиного податку першої - третьої груп повинні здійснювати розрахунки за відвантажені товари (виконані роботи, надані послуги) виключно в грошовій формі - готівковій або безготівковій. https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/2755-17#n6946
Тому якщо ви продали товар вашому покупцю, а він розрахувався не грошима, а бонусами (сертифікатами чи іншим подібними засобами), тобто ви не отримали на свій підприємницький рахунок ФОПа в банку грошових коштів, це буде вважатися порушенням умов перебування на спрощеній системі.
Крім того, в фіскальному чеку, який ви зобов'язані видати покупцю, ви повинні зазначити форму оплати - безготівкова - та засіб оплати. І вказувати бонуси однозначно не можна.
Про те ситуацію та наслідки, коли ФОП приймає до оплати сертифікати як різновид негрошової форми розрахунків, податківці згадують і в ЗІР (категорія 107.01.07) https://zir.tax.gov.ua/main/bz/view/?src=ques&id=42876

Що стосується утримання комісії саме за послуги (ліцензію, роялті) самого маркетплейсу, то теж такий варіант далекий від ідеального. Але так як багато маркетплейсів та сервісів переказу коштів (Glovo, OLX,Rozetka та інші) працюють по принципу утримання комісії, а не шляхом виставлення окремого рахунку на оплату, то до цього податківці ставляться більш лояльно. Хоча по суті це теж такий собі бартер за послуги, який фактично не дозволений єдиноподатникам.
Але при перерахуванні коштів від клієнта до продавця зазвичай в призначенні платежу такі маркетплейси вказують і повну суму, і суму утриманої комісії за свої послуги. Тому ФОП має можливість довести, що в дохід порахував всі надходження.

Отже, в вашому варіанті існують ризики позбавлення єдиного податку в разі перевірки, якщо оплату за свій товар ви отримуєте не грошовими коштами, а у вигляді бонусів, сертифікатів чи інших подібних засобів оплати, які не заходять безпосередньо на ваш розрахунковий рахунок ФОП.
Безпечніше буде не отримувати такі доходи чи уточнити у самого маркетплейсу можливості отримання саме грошових коштів від покупця, а не бонусів на віртуальний рахунок.

Раді допомогти, звертайтесь ще!