Все залежить від документального оформлення.

Працівник вважається мобілізованим до лав ЗСУ або таким, що підписав контракт на проходження військової служби, на підставі одного з наступних документів:

- військовий квиток;

- витяг з наказу військової частини;

- довідка з ТЦК або військової частини.

До отримання одного з цих документів варто табелювати працівнику нез’ясовані неявки - «НЗ».
Датою отримання одного із зазначених документів роботодавець видає наказ про увільнення від виконання посадових обов'язків такого працівника з дати, зазначеній у одному з названих документів, на період несення військової служби згідно з частиною 3 статті 119 КЗпП (https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/322-08#n709).
На весь період служби за працівником зберігається місце роботи і посада. Період мобілізації табелюємо "ІН".

Демобілізований працівник має стати на облік в ТЦК з відповідною позначкою у військовому квитку або, за наявності на те підстав, у його військовий квиток має бути проставлено позначку зняття з військового обліку.
На наступний день після внесення до військового квитка відповідного запису працівник має стати до роботи.
Про його повернення до виконання трудових обов’язків видається відповідний наказ.

Тобто, якщо його мобілізували (був документ про мобілізацію), його мали демобілізувати і зазначити це у військовому квитку. Якщо нічого з цього документально не підтверджується, весь період відсутності працівника на роботі табелюємо "НЗ" і після його повернення на роботу отримуємо письмові пояснення про причини відсутності.

В будь-якому випадку зарплата йому нараховуватись не була повинна, тому підстав для коригування звітності немає.

Раді допомогти, звертайтесь ще!