Заголовок тимчасово відсутній

Із наданої інформації випливає, що автомобіль юридично досі перебуває на обліку у СЦ МВС, тобто його не зняли з державної реєстрації, а лише зняли з військового обліку. Це і є ключова проблема, бо юридично ви залишаєтесь власником транспортного засобу, навіть якщо фактично він у покупця, і ви все провели у бухобліку.

Може бути, такий підхід — оформити відчуження як вибраковку (списання непридатного ТЗ) та реалізацію не транспортного засобу, а запчастин або брухту — це буде доречним і цілком правомірним, особливо якщо:

транспортний засіб фактично знищено або непридатний до експлуатації;
обидві сторони не мають претензій одна до одної;
реєстрація у МВС досі не скасована.
Вибраковка ТЗ можлива навіть без фізичного огляду, відповідно до п. 32 Порядку № 1388 (постанова КМУ від 07.09.1998 № 1388), якщо авто було знищено або непридатне до експлуатації. Для цього потрібен акт списання (внутрішній документ підприємства), після чого подається заява до СЦ МВС з проханням зняти авто з обліку у зв'язку з вибраковкою (утилізацією). https://hsc.gov.ua/2024/08/20/shho-take-vibrakuvannya-ta-yak-znyati-z-reyestratsiyi-znishhene-avto/

Після цього:

договір купівлі-продажу варто буде трактувати не як відчуження транспортного засобу, а як реалізацію залишків — вторсировини, запчастин, брухту (залежно від опису предмету договору);
це зніме всі ризики, пов’язані з тим, що авто ще на вашому балансі та обліку в СЦ МВС;
податкові наслідки не зміняться, якщо ви вже оформили ПН, провели дохід і списали актив.
Якщо це відповідає вашим цілям, обговоріть з покупцем можливість переоформлення ситуації за схемою "вибраковка — продаж залишків". Це юридично чисто, не суперечить інтересам сторін і відповідає реальному стану речей.

Раді допомогти, звертайтесь ще!