Розмір літер немає значення для ідентифікації Вас як юрособи чи платника ПДВ.

Вимоги до написання найменування юридичної особи, відокремленого підрозділу юридичної особи, у тому числі утвореної відповідно до законодавства іноземної держави, громадського формування, що не має статусу юридичної особи, крім організації профспілки, затверджені наказом Мінюсту від 05.03.2012 р. № 368/5 (у редакції наказу від
17.10.2018 року № 3236/5) (https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/z0367-12#n15):

"2. Для написання найменування використовуються великі та малі літери:

...Великі та малі літери, використані в установчих документах та при заповненні заяви у сфері державної реєстрації юридичних осіб, громадських формувань, що не мають статусу юридичної особи, фізичних осіб - підприємців та відокремлених підрозділів юридичної особи, утвореної відповідно до законодавства іноземної держави, вважаються тотожними."

Тому напишете Ви свою назву великими літерами маленькими - це не буде помилкою. За загальним правилом, в офіційних документах використовують написання назви підприємства, яке вказано в статуті. Відповідно і на печатці доцільно вказати літери так, як в статуті

Раді допомогти, звертайтесь ще!