На нашу думку, треба розуміти про яку вартість транспортних послуг йдеться.

Якщо це вартість транспортних послуг, які Ви оплачуєте окремо від товару (перезвізнику) і вони впливають тільки на митну вартість товару, але не впливають на фактурну вартість (їх немає в інвойсі постачальника товару), то такі транпортні послуги Ви розподіляєте в бухобліку так, як передбачено Вашою обліковою політикою

Якщо ж це транпортні послуги, які були вказані в самому інвойсі постачачальника товару одним рядком, і брокер розкидав їх в МД по фактрним цінам товару, то на нашу думку, це вже треба враховувати як ціну товару, а не окремі транпортні послуги. Було б добре, якщо б митний брокер знав зарані ваші правила розполілу таких рядкі інвойсу по товарам і зробив так, як у Вс прийнято

Якщо Ви зміните Дт 281 в бухобліку, то потім моожливі "нестиковки" даних митних декларацій як вхідних документів по ПДВ, та даними які використовуєете, наприклад, при визначенні бази оподаткування в Україні з дотриманням умов п. 188.1 ПКУ (https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/2755-17#n4551) - база оподаткування - не нижче ціни придбання, де в якості ціни придбання ДПС може брати саме дані про фактурну вартість з МД з тим розполідом транпортних витрат, які використав брокер, а не ті дані, які Ви провели в обліку по своїй обілковій політиці.

Додактово рекомендуємо отримати ІПК та роз`яснення МФУ

Раді допомогти, звертайтесь ще!