Ні, бухгалтер, перебуваючи у відпустці без збереження заробітної плати, не може виконувати свої трудові обов'язки, зокрема оплачувати рахунки. Це є порушенням трудового законодавства, оскільки відпустка — це період звільнення від роботи, за який не нараховується заробітна плата.

Відпустка без збереження заробітної плати, що надається на період дії воєнного стану, є тимчасовим звільненням працівника від виконання його трудових обов'язків. Якщо бухгалтер під час такої відпустки фактично працює (наприклад, проводить банківські платежі), це створює ризики як для роботодавця, так і для працівника:

За фактично відпрацьований час має бути нарахована заробітна плата.

Оскільки за відпрацьований час належить виплата зарплати, виникає обов'язок нарахувати та сплатити податок на доходи фізичних осіб (ПДФО), військовий збір та єдиний соціальний внесок (ЄСВ).
Щоб законно провести оплату рахунків, існують такі варіанти:

Переривання відпустки. Найбільш коректний спосіб — офіційно перервати відпустку бухгалтера на необхідний час (наприклад, на один день). Для цього видається наказ, за відпрацьований день нараховується заробітна плата, а після виконання роботи бухгалтер знову може піти у відпустку.
Тимчасове покладання обов'язків на іншу особу. Оскільки директор також перебуває у відпустці, виконання обов'язків бухгалтера можна покласти на іншого працівника, який не перебуває у відпустці. Якщо таких працівників немає, можна відкликати з відпустки директора. Відповідно до статті 105 Кодексу законів про працю України, виконання обов'язків тимчасово відсутнього працівника може бути покладено на іншого працівника з відповідною доплатою.
Виконання обов'язків директором. Директор може бути відкликаний з відпустки для виконання управлінських функцій, включно з проведенням платежів, використовуючи свій електронний підпис.
Видача довіреності. Для представництва інтересів організації у правовідносинах з третіми особами, зокрема в банках, уповноваженій особі (яка не перебуває у відпустці) може бути видана довіреність згідно з вимогами Цивільного кодексу України.

Раді допомогти, звертайтесь ще!