Насправді податківці в цьому разі праві.

Адже згідно з п. 9 НП(С)БО 9 - https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/z0751-99#o35 до складу первісної вартості запасів, зокрема, включають транспортно-заготівельні витрати (затрати на заготівлю запасів, оплата тарифів (фрахту) за вантажно-розвантажувальні роботи і транспортування запасів усіма видами транспорту до місця їх використання, включаючи витрати зі страхування ризиків транспортування запасів).

Отже, всі витрати на транспортування куплених товарів до місця їх використання (тобто на склад підприємства) мають потрапляти до первісної вартості товарів. Тобто осідати на рахунку 28. І вже потім під час реалізації таких товарів ці витрати (у складі первісної вартості товарів) мають опинитися у складі витрат (тобто на субрахунку 902).

Пряме включення таких витрат одразу на рахунок 93, припускаємо, скоріш за все тягне за собою відображення витрат на перевезення не в тому звітному періоді. Тому на цій підставі податкова може зняти Вам такі витрати. І, на жаль, мінімізувати ризики втрати витрат в цьому разі практично не можливо. Хіба, що вказувати податківцям на те, що так є помилка. І в цьому періоді мають бути зняті, але вони мають бути допоказані тоді, коли фактично була реалізація таких товарів (звичайно, якщо це чітко можна відслідкувати).

Раді допомогти, звертайтесь ще!